En el caso de las inclusiones no metálicas presentes en la masa fundida de aleaciones de aluminio —principalmente óxidos—, el refinado del aluminio permite eliminarlas de forma eficaz. En el caso de materiales más exigentes, también pueden eliminarse mediante filtración durante el proceso de colada. En cuanto a las impurezas metálicas, el método de tratamiento habitual consiste en convertir los factores nocivos en factores favorables. Es decir, se transforman en una segunda fase beneficiosa mediante el proceso de aleación, con el fin de mejorar las prestaciones del material y reducir costes.
Las aleaciones de aluminio fundidas a partir de residuos que contienen aluminio suelen contener un exceso de elementos metálicos, que deben eliminarse en la medida de lo posible. El método de oxidación puede utilizarse para eliminar de la masa fundida diversas impurezas metálicas que tienen una mayor afinidad por el oxígeno que el aluminio, así como por el oxígeno y el cloro. Por ejemplo, el magnesio, el zinc, el calcio, el circonio, el sodio, el potasio y otros elementos aceleran la oxidación y la cloración de estas impurezas al agitar la masa fundida. Estos óxidos y cloruros metálicos son insolubles en la aleación de aluminio líquida y pasan a formar parte de la escoria. Pueden eliminarse de la masa fundida de la aleación de aluminio mediante el desnatado.
La diferencia de solubilidad también puede utilizarse para eliminar las impurezas metálicas de la solución de aleación de aluminio. Por ejemplo, la aleación de aluminio contaminada con impurezas se somete a un proceso eutéctico con un metal capaz de disolver el aluminio sin disolver las impurezas, y a continuación el líquido de la aleación de aluminio se separa mediante Filtración CFF, y a continuación el metal añadido se elimina mediante destilación al vacío. Normalmente, se añaden magnesio, zinc y mercurio para eliminar el hierro, el silicio y otras impurezas del aluminio, y luego se recurre a la destilación al vacío para eliminar estos metales añadidos. Por ejemplo, después de que la aleación de aluminio contaminada con impurezas se haya sometido a un proceso eutéctico con magnesio 30%, se deja reposar la aleación durante un tiempo a una temperatura cercana a la eutéctica para filtrar las fases cristalinas precipitadas primarias que contienen hierro y silicio, y, a continuación, se realiza una desorción al vacío a 850 °C. El magnesio y las impurezas con alta presión de vapor, como el zinc y el plomo, también se eliminan junto con el magnesio, y tras la eliminación de este se obtiene una aleación de aluminio pura. En circunstancias normales, este proceso no se adopta en la industria secundaria del aluminio, ya que su coste es demasiado elevado.

Con el fin de mejorar aún más la calidad del aluminio fundido, o cuando determinados grados de aleaciones de aluminio requieren un control estricto del contenido de hidrógeno y de las inclusiones, se pueden emplear métodos de refinado combinados, es decir, se utilizan dos métodos de refinado al mismo tiempo. Por ejemplo, refinado con sal de cloro + filtración, soplado con argón + refinado por flujo y otros métodos pueden ofrecer mejores resultados que el refinado exclusivo de aluminio.
En comparación con la producción de lingotes a partir de lingotes de aluminio destinados a la refundición, el contenido de hidrógeno, inclusiones no metálicas e impurezas de metales distintos del aluminio en la masa fundida de aluminio reciclado es mucho mayor que el de las masas fundidas de aluminio y aleaciones producidas mediante la refundición de lingotes de aluminio. Si no se refina, es difícil garantizar la calidad de los lingotes de aluminio reciclado. El método para eliminar el hidrógeno y las inclusiones no metálicas del aluminio fundido secundario es básicamente el mismo que el utilizado para producir el lingote a partir de lingotes refundidos.